Steins; Portão está definido, no verão de 2010, aproximadamente um ano após os acontecimentos que tiveram lugar em Chaos; Head, em Akihabara. Steins; Gate é sobre um grupo de amigos que personalizaram suas microondas em um dispositivo que pode enviar mensagens de texto ao passado. Como eles realizam experiências diferentes, uma organização chamada SERN, que tem vindo a fazer a sua própria pesquisa sobre viagem no tempo, acompanha-los e agora os personagens têm de encontrar uma maneira para evitar ser capturado por eles.